Основни проблем управљања отпадним водама представља њихов адекватан третман, који се примењује у зависности од квалитета саме отпадне воде и последица које могу настати уливањем у реципијент.

Основни индикатори стања квалитета отпадне воде су: температура, мирис, боја, садржај суспендованих материја, pH вредност, садржај органске материје (који се одређује преко БПК₅ и ХПК), укупан број колиформних бактерија. Уколико се отпадне воде испуштају у водоток или језера која служе за водоснабдевање, поред поменутих параметара, одређује се и садржај нутријената (азота и фосфора), тешких метала, а по потреби и других токсичних материја. Сталном контролом наведених параметара добија се увид у стање квалитета отпадних вода и вода реципијента и уколико је потребно предузимају се одговарајуће мера ради спречавања негативних утицаја на животну средину.